红水晶和红玛瑙的结构不同，红水晶属于三方晶系，常呈六棱柱状，红玛瑙常呈致密块状形成各种构造。成分不同，红水晶是石英结晶体矿物，红玛瑙是混有蛋白石和隐晶质石英的纹带状块体。硬度不同，红水晶的硬度为7度，红玛瑙硬度为6.5度。

1、结构

红水晶

红水晶和红玛瑙的结构不同，红水晶属于三方晶系，常呈六棱柱状，是六方柱和菱面体的聚形。红玛瑙常呈致密块状形成各种构造，以同心圆构造最为常见。

2、成分

红玛瑙

红水晶和红玛瑙的成分不同，红水晶是一种石英结晶体矿物，是二氧化硅结晶最完美的形态。红玛瑙是混有蛋白石和隐晶质石英的纹带状块体，二氧化硅胶化脱水后的形态。

3、硬度

红水晶

红水晶和红玛瑙的硬度不同，红水晶的硬度为摩氏7度左右，质地较为坚硬。红玛瑙的硬度为摩氏6.5~7度左右，比红水晶要略逊一筹，红水晶会在红玛瑙表面留下痕迹。